[[size=[b]6]size=[b]6]1861年8月26日，“石室”正式破土动工，奠基礼在1863年12月8日举行，明稽章曾分别从耶路撒冷及罗马运来泥土各一千克置于基下，表达天主教“创立于东方之耶路撒冷，兴起于西方之罗马”之意。如今，教堂正面的东侧墙角下“Jerusalem 1863”、西侧墙角下“Rome 1863”的刻字依旧赫然可见。
1864年，法国教会专门请来了两位极有才华的建筑师Vonutrin和Humbert主持，他们采纳了哥特式建筑风格，仿巴黎圣克洛蒂尔德大教堂进行了设计。建教堂的石料从新安(现宝安县)牛头角、茶果山等处采运而来。据史料记载，开采石料达7年之久。教堂整体用花岗岩石砌造，这也是百姓直呼其为“石室”的原因。
后来，两位法国建筑师由于水土不服相继离开，具体指挥完成这一巨大工程的是广东揭西的石匠蔡孝。1888年，“石室”圣心大教堂终于落成，历时25年。然而，创建人明稽章没有看到这一天，他于1886年在巴黎辞世。
